Le BionicCobot est commandé intuitivement via une interface utilisateur graphique développée spécialement à cet effet. L'utilisateur peut choisir parmi diverses actions préprogrammées telles que « saisir », « enregistrer un point » ou « conduire » sans avoir à les saisir lui-même dans un langage de programmation complexe. Même les réglages complexes tels que le paramétrage sont enlevés à l'utilisateur lors de la première étape. Le logiciel sélectionne automatiquement des valeurs par défaut que l'opérateur peut toutefois modifier pour les paramètres (valeurs variables qui doivent être communiquées au logiciel pour qu'il puisse effectuer les tâches souhaitées, telles que la vitesse à laquelle le bras du robot se déplace).
Les fonctions du robot sont représentées dans le logiciel avec des symboles faciles à comprendre. De cette façon, l'opérateur peut faire glisser et déposer les actions souhaitées sur une tablette dans une sorte d'axe du temps et les enchaîner selon les besoins, comme un programme de montage vidéo. Les répétitions de certaines séquences de mouvements ou de conditions if-then plus complexes peuvent également être facilement compilées et enregistrées. Ensuite, il peut voir virtuellement dans la simulation sur la tablette ou dans le mouvement réel comment le BionicCobot exécute cette séquence de mouvements, corriger immédiatement toute erreur pendant le déroulement ou ajuster des paramètres individuels tels que la vitesse.