El BionicCobot se maneja de forma intuitiva a través de una interfaz gráfica de usuario desarrollada específicamente. El usuario puede elegir entre diferentes acciones preprogramadas como "sujetar", "guardar un punto" o "desplazar" sin tener que introducirlas en un lenguaje de programación complejo. El usuario tampoco tiene que lidiar en una primera etapa con configuraciones laboriosas, como la parametrización. El software selecciona automáticamente valores predeterminados para los parámetros (valores variables que deben comunicarse al software para que pueda realizar las tareas deseadas, como la velocidad a la que se mueve el brazo del robot), pero que el operador puede cambiar.
Las funciones del robot están representadas en el software con símbolos fáciles de entender. De esta forma, el operador puede arrastrar y soltar las acciones deseadas en una tableta en una especie de línea temporal y disponerlas sucesivamente según sea necesario, de forma similar a un programa de edición de vídeo. Las repeticiones de determinados movimientos o condiciones más complejas de si-entonces también se pueden compilar y guardar fácilmente. A continuación, el operador puede ver virtualmente en la simulación en la tableta o en el movimiento real cómo BionicCobot ejecuta esta secuencia de movimientos, corregir de inmediato cualquier error en el proceso o adaptar parámetros individuales como la velocidad.